コドラートで植物を数える：植物学者のシナリオ

野外調査の前に、コドラート調査をどう設定すべきか

草地にひざをつく前に、マーレンはひと晩かけて机に向かい、プロトコルをアプリに当てはめていきます。アプリでは、最大3階層まで入れ子にできるカテゴリー、その中に置くカウンター、各カウンターの中に置くタグを使えます。

彼女が決めた構成は次のとおりです。

• カテゴリーの第1階層：調査地「低地草原」
• 第2階層：トランセクト「T1」「T2」「T3」
• 第3階層：調査回「第1回 5月」「第2回 6月」「第3回 7月」
• カウンター：コドラートごとに1つ。「T1-Q01」から「T1-Q10」と命名
• タグ：指標種ごとに1つ

彼女は現在の調査回のカテゴリーをピン留めして、リストの一番上に表示されるようにしています。バックアップをコピーとしてインポートすれば、次の調査回用にカウンターを複製することもできますが、彼女は調査回ごとにコドラートを新しく作るほうを好みます。そうすれば、すべての名前を区画図と照らし合わせて確認せざるを得なくなるからです。

同僚からは、種をカウンターに、コドラートをタグにする逆の構成を勧められます。マーレンは紙の上で試してみたうえで、この案を採用しませんでした。彼女の分析ではコドラートを標本単位として扱うため、エクスポートの1行が1つのコドラートに対応している必要があるからです。

種ごとのタグとその設定

どのコドラートのカウンターにも、同じ8つのタグを、同じ順番、同じ色で設定します。イエローラトル（Rhinanthus minor）は黄色、ノップウィード（ヤグルマギク属）は紫、セイヨウミヤコグサはオレンジ、といった具合です。花の色にタグの色を合わせるのはちょっとした工夫ですが、疲れて画面を斜めから見ているときにこそ効果を発揮します。

タグにはそれぞれ、ステップ、値、任意の目標、タイマー、ストップウォッチ、位置、バーコード、メモがあります。茎を数える種のステップは1のままです。5株を1まとまりとして記録するイネ科植物が1種あるので、そのタグのステップを5に設定し、カウンターの説明に「ステップ5 = 1まとまり」と書いておきます。

タグの位置は「低地草原 T1 Q01」という入力テキストにしています。スマートフォンのGPSでは、数メートルしか離れていないコドラートを区別できるほどの精度が出ないからです。ただし各トランセクトの最初のコドラートにはGPS座標も保存し、後で誰かが区画を探し直すときのおおまかな基準点にしています。

野外での1日

最初の調査回、マーレンは枠を置き、ひざをついたままT1に沿って作業を進めます。コドラートのカウンターを開いてリスト表示にすると、8種がそれぞれ行として並び、各行にマイナスとプラスのボタンと現在の値が表示されます。

最も数の多い種については、シングル表示に切り替えます。大きな円形カウンターが画面いっぱいに表示されるので、茎から目を離さず、画面をよく見ないままタップできます。その下のタグカードには位置と最新のメモが表示されるため、正しいコドラートにいることも確認できます。

音量ボタンでカウントする

2日目、彼女は設定で音量ボタンによるカウントを有効にします。この機能は初期設定ではオフになっています。音量アップをプラス、音量ダウンをマイナスに割り当て、それぞれに短い振動を個別に設定し、音はミュートのままにします。これで片手でスマートフォンを持ち、もう片方の手で草をかき分けられるようになります。フォアグラウンドサービスによって画面がオフの状態でもカウントは続き、ロック画面の通知にもマイナス、プラス、「停止」のボタンが表示されます。彼女のスマートフォンではシステムの音量バーが一瞬表示されますが、そのうち気にならなくなります。

計数を終えたコドラートをロックする

1つのコドラートを数え終えたら、そのカウンターをロックします。ひざをつき、立ち上がり、スマートフォンをポケットにしまう動作では、意図しないタッチが何度も起こります。ロックしておけば、それで確定済みのデータが変わることはありません。ロックの解除は、意識して1回タップするだけです。

同定の難しい標本の写真

野外では確信をもって同定できない植物もあります。マーレンはそうした植物を該当するタグで撮影します。1つのタグには最大6枚の写真を保存できます。フォトエディターでブラシを使って矢印を手早く描き、コドラート番号をテキストで加え、画像を回転させて向きを直します。後ですべての写真のギャラリーを開くと、すべての画像がタグのラベルと日付付きで表示されるので、同定に自信のない標本の写真をまとめて、イネ科に詳しい同僚に送るのも簡単です。

個々のカウント記録にもメモを付けておきます。「2株は食害あり、茎のみ計数」「枠が10 cmずれたため置き直し」といったメモです。これらはカウントと一緒にエクスポートに含まれます。

夕方の確認作業

車に戻ると、マーレンは短い確認作業を行います。

1. 「すべてのメモ」画面を開き、その日のメモを時刻順にすべて読む。
2. 合計が意外な値になったコドラートは履歴を開く。各イベントには、時刻、ステップ、変更前と変更後の値、タグのラベル、メモや写真のアイコンが表示される。
3. いくつかの合計を紙の予備用紙と照合する。
4. 現在の調査回のカテゴリーだけを選んで写真付きのバックアップZIPを作成し、ノートパソコンにコピーする。

履歴は検索できないため、コドラートを1つずつ確認していきます。初日、T1-Q04の最後に、覚えのないマイナスのタップがまとまって記録されているのに気づきます。タイムスタンプを見ると、車へ戻る途中に記録されたものでした。これはまさにロックで防げる問題で、それ以来、彼女はすべてのコドラートをロックするようになります。

調査補助者との作業

6月の調査回では、マーレンがT1とT2を担当する間に、学生のテオが自分のスマートフォンでT3を数えます。スマートフォン同士のリアルタイム同期はないので、段取りはシンプルです。テオはT3のカテゴリーの中だけで作業し、1日の終わりにそのカテゴリーのバックアップZIPを作成します。

マーレンがそれをインポートすると、プレビューにカウンターの一覧が表示され、重複の扱いを置換、コピー、スキップから選ぶよう求められます。彼女のスマートフォンにはまだT3がないので、重複は発生しません。後の調査回で、両方のスマートフォンに古いT3のコピーがある状態になったときは、テオの新しいカウンターで置換することを選び、ZIPファイルは日付付きの記録として保管します。

2人は、2つのコドラートについてスマートフォンを交換し、互いの結果を見ずに数えて比較することにもしました。正式な研究計画を立てなくても、これで観察者による違いをおおまかに把握できます。

調査回ごとのコドラートのカウントをどう比較するか

調査回と調査回の間は、各コドラートのカウンターのダッシュボードを見れば、全体像をすばやく把握できます。合計、増加と減少、7日間の活動グラフ、種別の円グラフです。円グラフは分析ではありませんが、T2-Q07が1種に優占されている一方で、隣接するコドラートでは複数の種が混在していることがひと目でわかります。そこで彼女は、次の調査回で区画の境界を確認することにします。

本格的な比較は、スマートフォンではなく表計算ソフトで行います。調査回はそれぞれ別のカテゴリーに入っていて、アプリは調査回をまたいだ統計処理を想定して作られていないからです。

シーズン終了：分析

8月、マーレンは調査回ごとのカウンターをCSVでエクスポートします。エクスポートオプションでは概要とロケーションにチェックを入れ、記録としてメモも加えます。個々のタップまでは必要ないので、イベントはオフのままです。概要からはコドラートごと・種ごとの合計が得られ、ロケーションのセクションには彼女が入力したコドラート番号が含まれます。

彼女はファイルをRに読み込み、調査回ごとに結合して、コドラート×種のマトリックスに整形します。土地の所有者にはExcelのエクスポートを渡し、プロジェクトのアーカイブには写真が埋め込まれたHTMLレポートを保存します。HTMLレポートは特別なソフトがなくても読みやすいからです。